马会通过自由交配的方式恒温胎生进行繁殖。公马发情后会和母马进行交配，通常在交配后13-18天以内没有再次发情，就是怀孕成功。母马怀孕后会出现妊娠反应，在340天左右，可成功分娩。马在出生后10-18月龄左右时可达到性成熟，会开始发情，单不建议立即配种。
马、驴和斑马本是3个独立的物种，已出现生殖隔离。但有趣的是，马和、驴和斑马杂交都能产生后代。骡子是马和驴的杂交体，分为马骡(驴♂×马♀)和驴骡(马♂×驴♀)。通常认为雄骡没有生殖能力，但有对雌骡产驹的相关报道，并有报道称马骡的受孕率显著高于驴骡(约7倍)。
